マイニンテンドーストアは、ニンテンドーアカウントをお持ちの方がご利用いただけるオンラインストアです。本体・ソフトのほかにも、ここでしか手に入らない限定商品なども、このマイニンテンドーストアで販売されます。
1/23（月）からマイニンテンドーストアで予約購入できる商品例
Nintendo Switch
発売日 ：2017年3月3日（金）
販売価格：29,980円（税別）
マイニンテンドーストアだけのサービスとして、Joy-ConとJoy-Conストラップのカラーを自由に組み合わせてカスタマイズ！
※マイニンテンドーストアでNintendo Switch本体をご購入した場合、マイニンテンドーポイントのゴールドポイントを300ポイントゲット。
マイニンテンドーストア限定！『ゼルダの伝説 ブレス オブ ザ ワイルド DELUXE COLLECTOR’S EDITION』（数量限定）
発売日 ：2017年3月3日（金）
販売価格：13,870円（税別）
『ゼルダの伝説 ブレス オブ ザ ワイルド』のマイニンテンドーストア限定版。
付属の『ゼルダの伝説』シリーズを象徴するアイテム「マスターソード」を忠実に立体化。全高は約25cm。
Nintendo Switch キャリングケース（画面保護シート付き）
発売日 ：2017年3月3日（金）
販売価格：1,980円（税別）
Nintendo Switch本体用キャリングケースと、液晶画面をキズや汚れから守る保護シートのセット。
オープン記念！本体とソフトとの同時購入で限定の特大（B2）ポスターカレンダーをプレゼント！
ただし、数量限定。
1/23（月）のサイトオープン以降、マイニンテンドーストアに初めてログインすると、マイニンテンドーのプラチナポイント100ポイントがもらえる（2017年3月3日までの期間限定）。